Ιδρυματικό Αποθετήριο Τ.Ε.Ι. Πελοποννήσου
Ανάπτυξη υπολογιστικής μεθοδολογίας για τη μελέτη της γενετικής προδιάθεσης για μεταβολικό σύνδρομο σε ποντίκια
Αποθετήριο DSpace/Manakin
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
| dc.contributor.author | Σωφρονά, Αγγελική | el |
| dc.date.accessioned | 2019-09-12T11:55:35Z | |
| dc.date.available | 2019-09-12T11:55:35Z | |
| dc.date.issued | 2019-09-12 | |
| dc.identifier.uri | http://nestor.teipel.gr/xmlui/handle/123456789/18014 | |
| dc.rights | Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/us/ | * |
| dc.title | Ανάπτυξη υπολογιστικής μεθοδολογίας για τη μελέτη της γενετικής προδιάθεσης για μεταβολικό σύνδρομο σε ποντίκια | el |
| heal.type | Προπτυχιακή/Διπλωματική εργασία | |
| heal.keyword | Υπολογιστική μεθοδολογία | el |
| heal.keyword | Γενετική προδιάθεση | el |
| heal.keyword | Μεταβολισμός | el |
| heal.language | el | |
| heal.access | free | |
| heal.recordProvider | ΤΕΙ Πελοποννήσου, Σχολή Τεχνολογικών Εφαρμογών, Τμήμα Μηχανικών Πληροφορικής ΤΕ | el |
| heal.publicationDate | 2017-11-30 | |
| heal.abstract | Σε αυτήν την εργασία εξετάζεται η γονιδιακή προδιάθεση στην παχυσαρκία που εμφανίζουν οργανισμοί ποντικιών (mus musculus) και η συσχέτισή της με ασθένειες της καρδιάς με τη βοήθεια της Χαρτογράφησης Γονιδιακών Τόπων Ποσοτικών Ιδιοτήτων (Quantitative Trait Locus mapping). Για την ολοκλήρωση της εργασίας, πρώτα μελέτησα τον ορισμό του Μεταβολικού Συνδρόμου και κυρίως, δύο από τις κύριες παθήσεις που συσχετίζονται με την παχυσαρκία και που αποτελούν το Μεταβολικό Σύνδρομο. Οι δύο αυτές παθήσεις είναι ο Σακχαρώδης Διαβήτης ο Τύπου 2 (ΣΔ2) και η Καρδιοπάθεια. Η κατανόηση του πειράματος που έγινε σε σειρές γενετικά ίδιων ποντικιών (Collaborative Cross Lines), ήταν σημαντική για να χρησιμοποιηθούν τα τεχνολογικά μέσα που αργότερα βοήθησαν στους υπολογισμούς της Βιοπληροφορικής για να επιτευχθεί η Χαρτογράφηση Γονιδιακών Τόπων Ποσοτικών Ιδιοτήτων. Στο πείραμα χρησιμοποιήθηκαν 634 ποντικάκια τα οποία υποβλήθηκαν σε δίαιτα υψηλής περιεκτικότητας σε λιπαρά (High – fat diet). Από αυτά, στα 393 ποντικάκια μετρήθηκε το βάρος της καρδιάς στο τέλος της δίαιτας, για να ποσοτικοποιηθεί ο φαινότυπος του βάρους της καρδιάς ως προς το συνολικό βάρος των ποντικιών.. Ο αλγόριθμος έτρεξε σε Λειτουργικό Σύστημα (OS) MacOS και η γλώσσα προγραμματισμού που χρησιμοποιήθηκε είναι η R με τη βοήθεια του RStudio. Στη συνέχεια αναλύονται τα βήματα της QTL Ανάλυσης (Quantitative Trait Locus Analysis) και η λειτουργία του αλγορίθμου HAPPY μέσα από τα οποία ανακατασκευάστηκε ο γονότυπος κάθε ξεχωριστής σειράς ποντικιών με βάση τους γονικούς γονότυπους και στη συνέχεια εντοπίστηκαν οι γενετικοί τόποι που εμπλέκονται στο φαινότυπο. Τα γονίδια που βρέθηκαν, έτρεξαν στο εργαλείο BioInfoMiner (ΒΙΜ) και ως αποτέλεσμα βρέθηκαν οι στατιστικά σημαντικά εκφρασμένες βιολογικές οντολογίες και τα γονίδια που παίζουν κεντρικό ρυθμιστικό ρόλο στο οντολογικό δίκτυο. Χαρτογράφηση Γονιδιακών Τόπων Ποσοτικών Ιδιοτήτων είναι μία επιστημονική μέθοδος που τα τελευταία χρόνια έχει ξεκινήσει να χρησιμοποιείται όλο και περισσότερο από ερευνητές στον χώρο της Ιατρικής, της Βιολογίας και της Βιοπληροφορικής και μπορεί να βοηθήσει στην πρόληψη και την προκλινική διάγνωση για κάποιο νόσημα και να βοηθήσει στην βελτίωση της ανθρώπινης υγείας. | el |
| heal.advisorName | Μάργαρης, Διονύσιος | el |
| heal.committeeMemberName | n/a | el |
| heal.academicPublisher | Σχολή Τεχνολογικών Εφαρμογών, Τμήμα Μηχανικών Πληροφορικής ΤΕ | el |
| heal.academicPublisherID | teipel | |
| heal.fullTextAvailability | true |
Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο
Οι παρακάτω άδειες σχετίζονται με αυτό το τεκμήριο:
Αυτό το τεκμήριο εμφανίζεται στην ακόλουθη συλλογή(ές)
Εκτός από όπου ορίζεται κάτι διαφορετικό, αυτή η άδεια περιγράφετε ωςΑναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες